Σε περίπτωση θεραπευτικής διακοπής της κύησης το παράσιτο αποκαλύπτεται στο πλαίσιο του πλακούντα και του εμβρυικού εγκεφάλου κατά την ιστολογική εξέταση.
Όταν η κύηση συνεχιστεί ανεξάρτητα αν το έμβρυο θεωρείται υγιές ή προσβεβλημένο, η τακτική υπερηχογραφική παρακολούθηση και ο αυστηρός νεογνικός έλεγχος είναι απαραίτητοι.
Ο νεογνικός έλεγχος συνίσταται στην εξέταση του πλακούντα, του αίματος του ομφαλίου λώρου και του αίματος της μητέρας. Ο πλακούντας και το αίμα του ομφαλίου λώρου μπαίνουν για καλλιέργεια. Η ανάλυση με PCR είναι δυνατή.
Η ορολογική μελέτη είναι ταυτόσημη με αυτή που γίνεται στο εμβρυικό αίμα. Εξάλλου, γίνεται πλήρης νεογνική αξιολόγηση η οποία περιλαμβάνει την πλήρη νευρολογική εξέταση, ακτινογραφία κρανίου, εξέταση του βυθού του οφθαλμού, υπερηχογράφημα εγκεφάλου. Συμπληρωματικές αιματολογικές εξετάσεις γίνονται κατά τη διάρκεια της πρώτης εβδομάδας. Η παρουσία του παράσιτου μέσα στον πλακούντα ή στο αίμα του λώρου και η παρουσία ειδικών αντισωμάτων IgM, IgA ή IgE, ελεγχόμενα τη 10η ημέρα, μαρτυρούν συγγενή τοξοπλάσμωση.
Στη συνέχεια, επαναλαμβάνονται στο νεογνό ορολογικές εξετάσεις κάθε μήνα και στη συνέχεια κάθε δύο μήνες κατά τη διάρκεια του πρώτου έτους. Στην περίπτωση συγγενούς τοξοπλάσμωσης, εφαρμόζεται παρασιτοκτόνος θεραπεία. Στις άλλες περιπτώσεις, η μείωση των τιμών των IgG, που μεταδόθηκαν από τη μητέρα, παρακολουθείται τακτικά κάθε μήνα. Αυτά κατά γενικό κανόνα εξαφανίζονται σε διάστημα έξι έως οκτώ μηνών.
